Giao thức mật mã là các giao thức truyền thông được thiết kế với mục đích cung cấp một số chức năng liên quan đến an ninh máy tính sử dụng các kỹ thuật mật mã. Các tính năng thường gặp là tính bí mật, tính toàn vẹn và tính không thể phủ nhận/hoặc ẩn danh tùy theo từng ứng dụng cụ thể. Khái niệm giao thức ở đây cần được hiểu rộng: nó bao gồm cả những giao dịch không trực tuyến, chẳng hạn như mật mã hóa email...